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Interne de santé publique
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seuil de significativité

le Lun 2 Juil - 16:52
Question d'une étudiante:
J’avais juste une question à propos du seuil significatif. Quand on a un p ajusté pour limiter le risque d’inflation du risque alpha (dans les analyses intermédiaires par exemple), est ce qu' on prend comme seuil significatif le p ajusté (pas exemple < 0,001) ou alpha fixé (0,05). Merci


Dernière édition par mpascard le Lun 2 Juil - 17:14, édité 1 fois
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Re: seuil de significativité

le Lun 2 Juil - 16:58
Il y a plusieurs façons de maîtriser l'inflation du risque alpha. L'une d'entre elle consiste à prendre, comme tu le dis dans ton mail, un seuil de significativité pour le petit p de 0.001 pour toutes les analyses intermédiaires pour que à la fin tu puisses conclure avec un risque alpha (risque de conclure à tort à une différence) de 5% (il faut bien faire la différence entre seuil de significativité du petit p et risque alpha).
Exemple: si 5 analyses intermédiaires sont prévues et qu'à la 3ème le petit p est inférieur à 0.001, l'hypothèse H0 sera rejetée avec un risque alpha de 5% et non pas avec un risque alpha de 0.1% qui n'est pas le risque alpha mais le seuil de significativité choisi pour le petit p pour les analyses intermédiaires afin qu'à la fin le risque alpha soit de 5%.
Petite précision, dans le tableau sur ce lien https://en.wikipedia.org/wiki/Haybittle%E2%80%93Peto_boundary, tu as les seuils de significativité pour chaque analyse intermédiaire avec la méthode dont tu parles (il en existe plusieurs) et tu peux voir que si tu as 5 analyses intermédiaires de prévues, si lors de la 5ème analyse intermédiaire le petit p est inférieur à 0.05, tu pourras rejeter l'hypothèse H0 avec un risque alpha de 5% (cette méthode à été construite pour pouvoir fixer ce seuil de 0.05 pour la dernière analyse afin de ne pas trop perturber les lecteurs).

Par ailleurs, tu utilises le terme "p ajusté", est-ce que tu l'as vu écrit dans un article ou est-ce toi qui le nomme ainsi ?
Dans le premier cas, j'ai besoin que tu m'envoies l'article pour t'expliquer et pour ne pas te submerger d'informations (si ce n'est pas déjà le cas).
Dans le 2ème cas, tu n'utilises pas le bon terme: c'est seuil de significativité du petit p pour les analyses intermédiaires.

N'hésite pas si ce n'est pas clair.
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Re: seuil de significativité

le Lun 2 Juil - 17:11
Réponse de l'étudiante:

Je ne peux pas envoyer l’article car il est dans les annales mais ils disent ça :
Du coup je pense que le seuil de 0,001 est juste pour le critère de jugement principal. J’ai vu dans d’autres article que c’etait le cas. Et pour le reste des annalyses le seuil reste à 0,05. C’est juste où je me trompe ?

Pour le p ajusté je ne crois pas l’avoir vu dans un article.

Si je comprends bien ce que tu veux dire, on ne  retient que le risque alpha à 5% à la fin de l’étude. Le 0,1% ces juste pour les analyses intermédiaires
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Re: seuil de significativité

le Lun 2 Juil - 17:12
"Si je comprends bien ce que tu veux dire, on ne retient que le risque alpha à 5% à la fin de l’étude. Le 0,1% ces juste pour les analyses intermédiaires"
=> Il ne faut pas que tu confondes le risque alpha qui est fixé à priori, et les seuils de significativité du petit p qui sont déterminé de façon à respecter ce risque alpha. A la fin de l'étude, tu conclus avec un risque alpha fixé à priori de te tromper (quelques soit les seuils de significativité choisi pour les analyses intermédiaires).
Dans le texte que tu m'as scanné tu peux lire "we calculated that for a risk of 5%", ce qui correspond au risque alpha qu'il ont choisi à priori et à partir duquel il ont calculé le nombre de sujets nécessaires. Ensuite pour chaque analyse, un petit p va être obtenu. On va comparer ce petit p à un seuil de significativité. Quand il n'y a pas d'analyses intermédiaires ou multiples, le seuil correspond au risque alpha. S'il y a des analyses intermédiaires ou multiples, les seuils de significativité de ces analyses vont être inférieurs.

"Du coup je pense que le seuil de 0,001 est juste pour le critère de jugement principal. J’ai vu dans d’autres article que c’était le cas. Et pour le reste des annalyses le seuil reste à 0,05. C’est juste où je me trompe ?"
Si les auteurs décident qu'à un moment t, ils feront une analyse intermédiaire pour le critère de jugement principal et pour le(s) critère(s) de jugement secondaire(s), ils doivent prendre le même seuil de significativité pour le critère de jugement principal et pour le(s) critère(s) de jugement secondaire(s), dans ton exemple, 0.001.
Si par contre les auteurs avaient prévu d'analyser le(s) critère(s) de jugement secondaire(s) que lorsque l'analyse donnait un résultat significatif pour le critère de jugement principal, le seuil de significativité pour le(s) critère(s) de jugement secondaire(s) sera de 0.05 et de 0.001 pour le critère de jugement principal.
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Re: seuil de significativité

le Lun 2 Juil - 17:12
Réponse de l'étudiante:
D’accord. Donc dans cet article là c’est pour le critère de jugement principal du coup. Mais sinon, s’ils ne précisent pas, le seuil de significativité avec lequel on peut dire qu’un résultat est significatif dans les tableaux est bien 0,05 ?
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Re: seuil de significativité

le Lun 2 Juil - 17:12
Selon la photo que tu as prise, oui c'est pour le critère de jugement principal (je ne peux pas savoir s'il y a des critères de jugement secondaires et comment ils ont décidé de les analyser).
Pour ta 2ème question, oui sinon ce sera dit dans le texte comme dans l'extrait que tu a photographié.
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Re: seuil de significativité

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